Clinton Truman Duffy sündis 4. augustil 1898 San Quentini linnas. Tema isa oli alates 1894. aastast San Quentini vangla valvur. Duffy käis San Quentini gümnaasiumis ja lõpetas keskkooli San Rafaeli keskkoolis. Kogu nende kooliaastate jooksul oli tal pikk suhe Gladys Carpenteriga, kelle isa oli vangla kapten. 1921. aasta detsembris said nad kaksabiellusid.

Esimese maailmasõja ajal teenis Duffy mereväes. Pärast teenistusest vabastamist töötas ta Northwestern Pacific Railroadis ja pärast seda ehitusfirmas. Hiljem sai temast isegi notar. 1929. aastal pidi Duffy minema San Quentini vangla direktori büroosse, et lasta notariaalselt tõestada üht dokumenti. Seal kuulis ta, kuidas direktor Holohan ütles, et ta vajab assistenti. Duffy võttis seda kuivõimalust kasutada võimalust saada seal tööd. Direktor ütles talle, et kui ta tahab seda tööd, võib ta selle saada. Ta tegi direktor Holohanile kõvasti tööd ja vabastas teda paljudest tüütutest kohustustest.

1935. aastal oleks vangla direktor Holohan peaaegu tapetud vanglamurdmise käigus. Mitmed vangid olid saanud kätte relvad ja läksid direktori koju, kui ta ja vangla juhatus lõunatasid. Vangid peksid Holohani teadvusetuks ja võtsid vangla juhatuse liikmed pantvangi. Juhatuse liikmeid pantvangi võttes lubati vangidel läbi vangla väravate sõita.

Varsti pärast seda juhtumit läks direktor Holohan pensionile ja tema asemele tuli Folsomi vangla direktor Court Smith. Smithil oli Folsomi vanglas oma assistent ja ta soovis teda San Quentinisse kaasa võtta. Kuna teda ei olnud enam vaja direktori assistendina, viidi Duffy vangla direktorite nõukogu sekretäri Mark Nooni assistendiks tingimisi vanglate nõukogusse.

Smithi ajal direktorina ei läinud San Quentinis asjad paremaks. Toimusid mitmed kuulamised halva toidu, tapmiste ja üldise jõhkruse kohta kinnipeetavate suhtes. Suure hulga uurimiste tõttu vabastati Smith ametist. Vangla nõukogu otsustas, et kuna Duffy oli sündinud ja kasvanud San Quentinis ning tal oli üle 11 aasta töökogemust vanglate haldamisel, teadis ta midagi sellest, kuidasvangla juhtkond. Nad pakkusid talle 30 päevaks ajutist direktori ametikohta, kuni nad otsivad talle asendajat. Ta oli selle ametikoha üle väga õnnelik.

Selle 30-päevase direktori ametikoha ajal tegi Duffy enamat kui lihtsalt selle eest, et vangla püsiks töökorras. Ta nägi selles võimalust muuta vangide kohtlemist. Esimene muudatus, mille ta tegi, oli igasuguse kehalise karistamise kaotamine. Ta vallandas isegi kõik töötajad, kes peksid vange ja osalesid kehaliste karistuste jagamisel. Duffy tegi nii head tööd kuidirektor, et direktorite nõukogu andis talle regulaarse nelja-aastase ametikoha.

Duffy jätkas oma ametiaja jooksul San Quentini vanglas edusammude tegemist. Ta alustas kohe tööd kinnipeetavate haridusprogrammiga. Ta uskus, et nad vajavad tegelikke õpetajaid, selle asemel, et kinnipeetavad üksteist õpetaksid. Ta tahtis tagada, et iga kinnipeetav vabaneks paremana, kui ta oli sinna sattudes.

Tema direktoriks oleku ajal tehti veel mitmeid reforme. Duffy vahetas kinnipeetavate duši all kasutatava merevee magevee vastu. Ta lõpetas isegi kinnipeetavate pea raseerimise ja pani nad kandma nummerdatud vormiriietust. Duffy kehtestas ka uue toitlustusprogrammi kohvikus ja palkas toitumisspetsialisti.

Duffy uskus, et kinnipeetavaid on võimalik rehabiliteerida ja neid tuleb kohelda õiglaselt. Ta käis isegi relvastamata läbi vanglaõue ja rääkis kinnipeetavatega regulaarselt. Tema töötajad ei suutnud uskuda, et ta suhtus nendesse kinnipeetavatesse kergekäeliselt. Ta kohtles neid mehi õiglaselt, pidades samas meeles, et vangla on mõeldud karistamiseks, kuid ka rehabiliteerimiseks.

Duffy lõi vanglas kutseõppeprogrammi ja lasi kinnipeetavatel müüa vööd ja rahakotte. Duffy oli ka esimene direktor, kes lubas vangidel oma kambris raadiot kuulata. Duffy asutas isegi Anonüümsete Alkohoolikute esimese vanglaosakonna. Tema abikaasa Gladys korraldas kinnipeetavatele iganädalast programmi. Ta oli kinnipeetavate seas tuntud kui "ema" Duffy, sest tema targad sõnad jajulgustamine.

Pärast 11 aastat direktorina andis Duffy San Quentini üle oma esimesele assistendile Harley Oliver Teetsile. Duffy töötas seejärel täiskasvanute asutuses ja sai hiljem seitsme sammu fondi riiklikuks presidendiks. Selle programmi lõi endine San Quentini vang Bill Sands, et aidata endisi kinnipeetavaid pärast vanglast vabanemist.

Clinton Truman Duffy oli üks enim imetletud vanglaametnikke USA karistusajaloos oma saavutuste tõttu San Quentini vanglas. Duffy kirjutas oma kogemustest San Quentini vanglas mitu raamatut ja pidas isegi mitmel korral loenguid surmanuhtluse vastu. Clinton Duffy suri 84-aastaselt Walnut Creekis, Californias.