Clinton Truman Duffy 4 Ağustos 1898'de San Quentin kasabasında doğdu. Babası 1894'ten beri San Quentin Hapishanesi'nde gardiyandı. San Quentin Gramer Okulu'na giden Duffy, lise eğitimini San Rafael Lisesi'nde tamamladı. Bu okul yılları boyunca, babası Tersane Kaptanı olan Gladys Carpenter ile uzun bir ilişkisi oldu. 1921 yılının Aralık ayında, ikisievlendiler.

I. Dünya Savaşı boyunca Deniz Piyadeleri'nde görev yapan Duffy, terhis olduktan sonra Northwestern Pacific Railroad'da ve daha sonra bir inşaat şirketinde çalıştı. Daha sonra noter bile oldu. 1929'da Duffy'nin bir belgeyi notere onaylatmak için San Quentin Hapishanesi'ndeki Müdür'ün ofisine gitmesi gerekti. Oradayken Müdür Holohan'ın bir asistana ihtiyacı olduğunu söylediğini duydu.Müdür ona işi isterse alabileceğini söyledi. Müdür Holohan için çok çalıştı ve onu pek çok sıkıcı görevden kurtardı.

1935 yılında, Müdür Holohan bir hapishane firarı sırasında neredeyse öldürülüyordu. Birkaç mahkum silahlara erişim sağlamış ve Müdür ile Hapishane Kurulu öğle yemeği yerken evine gitmişti. Mahkumlar Holohan'ı bayıltana kadar dövmüş ve Hapishane Kurulunu rehin almıştı. Kurul üyeleri rehineyken, mahkumların hapishane kapılarından geçmesine izin verildi.

Bu olaydan kısa bir süre sonra Müdür Holohan emekli oldu ve yerine Folsom Cezaevi Müdürü Court Smith atandı. Smith'in Folsom Cezaevinde kendi asistanı vardı ve onu San Quentin'e yanında götürmek istiyordu. Artık Müdürün asistanı olarak kendisine ihtiyaç duyulmadığı için Duffy, Cezaevi Müdürleri Kurulu Sekreteri Mark Noon'un asistanı olarak Şartlı Tahliye Kuruluna atandı.

Smith'in müdürlüğü sırasında San Quentin'de işler iyiye gitmedi. Kötü yemekler, cinayetler ve mahkumlara uygulanan genel vahşet hakkında birçok soruşturma yapıldı. Çok sayıda soruşturma nedeniyle Smith görevden alındı. Cezaevi Kurulu, Duffy'nin San Quentin'de doğup büyüdüğü ve cezaevi yönetiminde 11 yıldan fazla iş deneyimine sahip olduğu için bu konuda bir şeyler bildiğine karar verdi.Cezaevi yönetimi, yerine birini ararken ona 30 günlük geçici bir müdürlük görevi teklif etti. Bu görevi almaktan onur duydu.

Bu 30 günlük müdürlük görevi sırasında Duffy, hapishanenin çalışır durumda kalmasını sağlamaktan daha fazlasını yaptı. Bunu, mahkumlara davranış biçiminde bir fark yaratmak için bir fırsat olarak gördü. Yaptığı ilk değişiklik, her türlü bedensel cezayı kaldırmak oldu. Hatta mahkumları döven ve bedensel ceza uygulamasına katılan tüm personeli kovdu. Duffy, hapishane müdürü olarak harika bir iş çıkardı.Yönetim Kurulu kendisine dört yıllık düzenli bir görev verdi.

Görevi sırasında San Quentin Hapishanesi'nde ilerleme kaydetmeye devam eden Duffy, hemen mahkumlar için bir eğitim programı üzerinde çalışmaya başladı. Mahkumların birbirlerine öğretmeleri yerine gerçek öğretmenlere ihtiyaç duyduklarına inanıyordu. Mahkumların her birinin oraya geldiklerinden daha iyi bir adam olarak serbest bırakılmalarını sağlamak istiyordu.

Duffy'nin müdürlüğü sırasında başka reformlar da yapıldı. Duffy mahkumların duşlarını deniz suyundan tatlı suya çevirdi. Hatta mahkumların kafalarını tıraş etme ve onlara numaralı üniformalar giydirme uygulamasına son verdi. Duffy ayrıca kafeteryada yeni bir yemek programı başlattı ve bir diyetisyen işe aldı.

Duffy mahkumların rehabilite edilebileceğine ve onlara adil davranılması gerektiğine inanıyordu. Hatta hapishane avlusunda silahsız olarak dolaşır ve mahkumlarla düzenli olarak konuşurdu. Personeli onun bu mahkumlara karşı rahatlığına inanamazdı. Hapishanenin cezalandırmak ama aynı zamanda rehabilite etmek için var olduğunu akılda tutarak bu adamlara adil davranırdı.

Duffy, cezaevinde bir mesleki eğitim programı oluşturdu ve mahkumların kemer ve cüzdan satmalarına izin verdi Duffy ayrıca mahkumların hücrelerinde radyo dinlemelerine izin veren ilk müdürdü Duffy, Adsız Alkolikler'in ilk cezaevi bölümünü bile kurdu Duffy'nin eşi Gladys, mahkumlar için haftalık bir program hazırladı Duffy, bilgelik dolu sözleri nedeniyle mahkumlar tarafından "Anne" Duffy olarak biliniyorduTeşvik.

Duffy, 11 yıl müdürlük yaptıktan sonra San Quentin'i ilk yardımcısı Harley Oliver Teets'e devretti. Duffy, Yetişkinler İdaresi'nde çalışmaya devam etti ve daha sonra Yedi Adım Vakfı'nın ulusal başkanı oldu. Bu program, eski bir San Quentin mahkumu olan Bill Sands tarafından eski hükümlülere hapisten çıktıktan sonra yardım etmek amacıyla oluşturuldu.

Clinton Truman Duffy, San Quentin Cezaevi'ndeki başarıları nedeniyle ABD cezaevi tarihinde en çok takdir edilen cezaevi yöneticilerinden biriydi. Duffy, San Quentin Cezaevi'ndeki deneyimleri üzerine birkaç kitap yazdı ve hatta birçok kez idam cezasına karşı konferanslar verdi. Clinton Duffy 84 yaşında Walnut Creek, Kaliforniya'da vefat etti.