Clinton Truman Duffy va néixer el 4 d'agost de 1898 a la ciutat de San Quentin. El seu pare havia estat guàrdia a la presó de San Quentin des de 1894. Duffy va anar a la San Quentin Grammar School i va completar la seva educació secundària a San Rafael High School. Al llarg d'aquests anys escolars, va tenir una llarga relació amb Gladys Carpenter el pare de la qual era el capità del pati. El desembre de 1921, els dos es van casar.

Durant la Primera Guerra Mundial, Duffy va servir al cos de Marines. Quan va ser donat d'alta, va treballar per a Northwestern Pacific Railroad i després, una empresa de construcció. Més tard, fins i tot esdevingué notari. El 1929, Duffy va haver d'anar a l'oficina del Guardià a la presó de San Quintin per obtenir un document notarial. Mentre era allà, va sentir al director Holohan dir que necessitava un assistent. Duffy va aprofitar això com una oportunitat per aconseguir una feina allà. El director li va dir que si volia la feina, la podria tenir. Va treballar dur per al director Holohan i el va rellevar de molts deures tediosos.

El 1935, el director Holohan gairebé va ser assassinat durant una escapada a la presó. Diversos presoners havien tingut accés a les armes i van anar a casa del director mentre ell i la Junta de la presó estaven dinant. Els presoners van colpejar Holohan inconscient i van prendre la Junta de la Presó com a ostatge. Amb els membres de la junta com a ostatges, els presoners van poder passar per les portes de la presó.

Poc després d'això.incident, el director Holohan es va retirar i va ser substituït pel director de la presó de Folsom, Court Smith. Smith tenia el seu propi assistent a la presó de Folsom i volia portar-lo amb ell a San Quintín. Com que ja no era necessari com a assistent del director, Duffy va ser traslladat a la Junta de Libertad Condicional com a assistent de Mark Noon, secretari de la Junta de Directors de la Presó. no millora. Hi va haver diverses audiències sobre mal menjar, assassinats i brutalitat general als presoners. A causa del gran nombre d'investigacions, Smith va ser acomiadat. La Junta de la presó va decidir que com que Duffy havia nascut i crescut a San Quentin i tenia més d'11 anys d'experiència laboral a l'administració penitenciaria, sabia alguna cosa sobre la gestió de la presó. Li van oferir una plaça temporal de 30 dies com a vigilant mentre buscaven un substitut. Va tenir un honor tenir aquest càrrec.

Durant aquest càrrec de 30 dies com a director, Duffy va fer més que assegurar-se que la presó es mantingués en funcionament. Va veure això com una oportunitat per marcar la diferència en la manera de tractar els presos. El primer canvi que va fer va ser eliminar totes les formes de càstig corporal. Fins i tot va acomiadar tot el personal que havia apallissat els presos i va participar en l'aplicació de càstigs corporals. Duffy va fer una feina tan gran com a alcaide que la Junta Directiva li va donar un període regular de quatre anysnomenament.

Durant el seu nomenament, Duffy va continuar avançant a la presó de San Quentin. De seguida va començar a treballar en un programa educatiu per als interns. Creia que necessitaven professors reals que vinguessin en comptes que els presos s'ensenyen entre ells. Volia assegurar-se que cada un dels presos fos alliberat millor que quan hi van arribar.

Durant la seva etapa com al vigilant es van fer diverses reformes. Duffy va canviar les dutxes dels presos d'aigua de mar a aigua dolça. Fins i tot va deixar la pràctica d'afaitar el cap dels reclusos i fer-los portar uniformes numerats. Duffy també va instituir un nou programa d'alimentació a la cafeteria i va contractar un dietista.

Duffy creia que els presos podien ser rehabilitats i haurien de ser tractats de manera justa. Fins i tot caminava pel pati de la presó desarmat i parlava regularment amb els presos. El seu personal no es podia creure la seva facilitat amb aquests presoners. Tractaria aquests homes amb equitat tenint en compte que la presó hi era per castigar però també per rehabilitar.

Duffy va crear un programa de formació professional a la presó i va deixar que els presos venguessin cinturons i carteres. Duffy també va ser el primer vigilant que va permetre als presoners escoltar les ràdios a les seves cel·les. Duffy fins i tot va establir el primer capítol de la presó d'Alcohòlics Anònims. La seva dona, Gladys, va fer un programa setmanal per als reclusos. Era coneguda com a "mare" Duffyels reclusos per les seves paraules de saviesa i ànim.

Després d'11 anys com a alcaide, Duffy va lliurar San Quentin al seu primer assistent, Harley Oliver Teets. Duffy va continuar treballant per a l'Autoritat d'Adults i més tard es va convertir en president nacional de la Fundació Seven Steps. Aquest programa va ser creat per un antic reclus de San Quentin, Bill Sands, per ajudar els exconvictes després de sortir de la presó.

Clinton Truman Duffy va ser un dels administradors de presons més admirats de la història penal dels Estats Units a causa de la seva èxits a la presó de San Quintín. Duffy va escriure diversos llibres sobre les seves experiències a la presó de San Quentin i fins i tot va donar conferències contra la pena capital en diverses ocasions. Clinton Duffy va morir als 84 anys a Walnut Creek, Califòrnia.