Клинтън Труман Дъфи е роден на 4 август 1898 г. в град Сан Куентин. баща му е надзирател в затвора Сан Куентин от 1894 г. Дъфи учи в гимназията в Сан Куентин и завършва средното си образование в гимназията в Сан Рафаел. през тези ученически години той има дълга връзка с Гладис Карпентър, чийто баща е капитан на двора. през декември 1921 г. дваматаса се оженили.

По време на Първата световна война Дъфи служи в морската пехота. Когато е уволнен, работи за Northwestern Pacific Railroad, а след това - в строителна компания. По-късно дори става нотариус. През 1929 г. Дъфи трябва да отиде в кабинета на началника на затвора в Сан Куентин, за да завери нотариално един документ. Докато е там, той чува началника Холохан да казва, че има нужда от помощник.възможност да се възползва от шанса да получи работа там. Началникът му казал, че ако иска работата, може да я получи. Той работил усърдно за началника Холохан и го освободил от много досадни задължения.

През 1935 г. началникът на затвора Холохан едва не е убит по време на бягство от затвора. няколко затворници се сдобиват с оръжие и отиват в дома на началника, докато той и затворническата управа обядват. затворниците пребиват Холохан до безсъзнание и вземат за заложници затворническата управа. след като членовете на управата са взети за заложници, затворниците могат да преминат през портата на затвора.

Малко след този инцидент началникът на затвора Холохан се пенсионира и е заменен от началника на затвора Фолсъм, Корт Смит. Смит има свой собствен помощник в затвора Фолсъм и иска да го вземе със себе си в Сан Куентин. Тъй като вече не е необходим като помощник на началника, Дъфи е преместен в Съвета по предсрочно освобождаване като помощник на Марк Нун, секретар на Съвета на директорите на затворите.

По време на мандата на Смит като началник на затвора нещата в Сан Куентин не се подобряват. Провеждат се няколко изслушвания за лоша храна, убийства и цялостна жестокост към затворниците. Поради големия брой разследвания Смит е уволнен. Съветът на затвора решава, че тъй като Дъфи е роден и израснал в Сан Куентин и има над 11 години трудов стаж в администрацията на затвора, той знае нещо заРъководството на затвора. Предложиха му 30-дневен временен пост на надзирател, докато търсят заместник. За него беше чест да заеме този пост.

По време на 30-дневния си мандат като началник Дъфи направи нещо повече от това да осигури функционирането на затвора. Той видя в това възможност да промени начина, по който се отнасяха към затворниците. Първата промяна, която направи, беше да премахне всички форми на телесно наказание. Той дори уволни всички служители, които бяха биели затворници и участваха в раздаването на телесни наказания. Дъфи свърши толкова добра работа катоуправител, че Бордът на директорите му е дал редовен четиригодишен мандат.

По време на назначението си Дъфи продължава да постига напредък в затвора "Сан Куентин". Той веднага започва работа по образователна програма за затворниците. Смята, че те имат нужда от истински учители, вместо затворниците да се обучават помежду си. Иска да гарантира, че всеки от затворниците ще излезе на свобода по-добър, отколкото е бил, когато е дошъл там.

По време на работата си като началник на затвора Дъфи извършва още няколко реформи. той сменя душовете на затворниците от морска на сладка вода. той дори прекратява практиката на бръснене на главите на затворниците и ги кара да носят униформи с номера. Дъфи също така въвежда нова програма за хранене в столовата и наема диетолог.

Дъфи вярваше, че затворниците могат да бъдат реабилитирани и че към тях трябва да се отнасят справедливо. Той дори се разхождаше из двора на затвора невъоръжен и редовно разговаряше със затворниците. Служителите му не можеха да повярват на лекотата, с която се отнасяше към тези затворници. Той се отнасяше към тези мъже справедливо, като същевременно не забравяше, че затворът е създаден, за да наказва, но и да реабилитира.

Дъфи създава програма за професионално обучение в затвора и позволява на затворниците да продават колани и портфейли. Дъфи е и първият надзирател, който разрешава на затворниците да слушат радио в килиите си. Дъфи дори създава първия затворнически клон на Анонимните алкохолици. съпругата му Гладис провежда седмична програма за затворниците. тя е известна като "мама" Дъфи на затворниците заради мъдрите си думи инасърчаване.

След 11 години като началник на затвора Дъфи предава Сан Куентин на първия си помощник - Харли Оливър Тийтс. Дъфи продължава да работи в Управлението за възрастни, а по-късно става национален президент на фондация "Седем стъпки". Тази програма е създадена от бившия затворник от Сан Куентин Бил Сандс, за да помага на бивши затворници след излизането им от затвора.

Клинтън Труман Дъфи е един от най-уважаваните затворнически администратори в историята на САЩ заради постиженията си в затвора "Сан Куентин". Дъфи написва няколко книги за преживяванията си в затвора "Сан Куентин" и дори няколко пъти изнася лекции срещу смъртното наказание. Клинтън Дъфи умира на 84-годишна възраст в Уолнът Крийк, Калифорния.